Perder um pendrive hoje é muito comum. Eu sempre esqueço o meu em algum lugar, e acho depois de um tempo.
Hoje vale mais os dados nele armazenados do que o valor do proprio pen drive.
Para recuperar os dados perdidos eu recomendo “Backup” aquilo que a gente quase nunca faz.
Agora se você quer proteger os dados para quando perder o seu pendrive ninguém acessar indevidamente siga esse tutorial :

Lembrando que o BitLocker está disponível somente nos Windows 7 Ultimate e Enterprise.

Acesse Control Panel\System and Secuity\BitLocker Drive Encryption\ e selecione o drive que deseja criptografar

Defina uma senha que será usada para desbloquear o seu Pen Drive.

Salve ou imprima a chave de recuperação.

Clique em “start encrypt” e aguarde io termino da criptografia do disco,

Você verá que os ícones do seu pendrive ficarão com um cadeado fechado quando estiver bloqueado e aberto quando estiver desbloqueado
O desbloqueio ocorre quando você insere a senha defina no processo de habilitação do BitLocker.

Quando for usar novamente o seu pen drive você verá a seguinte janela:

Digite a senha para ter acesso aos dados.